Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r12G5E8G1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms