Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4933406M09RikG3XA12 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
4933406M09RikG3XA12 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
4933406M09RikG3XA12 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
4933406M09RikG3XA12 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4933406M09RikG3XA12 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933406M09RikG3XA12 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms