Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pcf11G3X9Z4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pcf11G3X9Z4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms