Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r58G3X9U3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms