Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NpcdF8VQB8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NpcdF8VQB8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms