Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ88

Gm5145, Predicted pseudogene 5145, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5145F8VQ88 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5145F8VQ88 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5145F8VQ88 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5145F8VQ88 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5145F8VQ88 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5145F8VQ88 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5145F8VQ88 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5145F8VQ88 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5145F8VQ88 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5145F8VQ88 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5145F8VQ88 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5145F8VQ88 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5145F8VQ88 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5145F8VQ88 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5145F8VQ88 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5145F8VQ88 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5145F8VQ88 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5145F8VQ88 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5145F8VQ88 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5145F8VQ88 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5145F8VQ88 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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