Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp32F8VPZ3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.8
Usp32F8VPZ3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp32F8VPZ3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms