Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

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Length 2,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BC067074F6RXI4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BC067074F6RXI4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC067074F6RXI4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC067074F6RXI4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC067074F6RXI4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC067074F6RXI4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC067074F6RXI4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC067074F6RXI4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BC067074F6RXI4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC067074F6RXI4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC067074F6RXI4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC067074F6RXI4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BC067074F6RXI4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BC067074F6RXI4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC067074F6RXI4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BC067074F6RXI4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC067074F6RXI4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC067074F6RXI4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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