Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm29094F6Q785 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm29094F6Q785 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm29094F6Q785 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms