Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc74aE9Q9U8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc74aE9Q9U8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc74aE9Q9U8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms