Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp31E9Q6Y8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp31E9Q6Y8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms