Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Tarbp1E9Q368 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms