Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd2E9Q1M1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms