Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc144bE9PVZ3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc144bE9PVZ3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms