Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syde2E9PUP1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Syde2E9PUP1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms