Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
4930444G20RikD3Z741 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930444G20RikD3Z741 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930444G20RikD3Z741 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
4930444G20RikD3Z741 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930444G20RikD3Z741 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930444G20RikD3Z741 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930444G20RikD3Z741 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930444G20RikD3Z741 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930444G20RikD3Z741 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930444G20RikD3Z741 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930444G20RikD3Z741 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930444G20RikD3Z741 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930444G20RikD3Z741 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930444G20RikD3Z741 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930444G20RikD3Z741 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930444G20RikD3Z741 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930444G20RikD3Z741 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930444G20RikD3Z741 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930444G20RikD3Z741 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms