Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem200bD3Z0P8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms