Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo5D3YW29 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rexo5D3YW29 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms