Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.28■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
1700018F24RikB2RW27 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700018F24RikB2RW27 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700018F24RikB2RW27 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms