Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clrn2B2RVW2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clrn2B2RVW2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clrn2B2RVW2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms