Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otud7bB2RUR8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms