Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trabd2bB1ATG9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trabd2bB1ATG9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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