Protein–RNA interactions for Protein: B1AT01

1700084M14Rik, RIKEN cDNA 1700084M14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700084M14RikB1AT01 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700084M14RikB1AT01 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700084M14RikB1AT01 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700084M14RikB1AT01 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700084M14RikB1AT01 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700084M14RikB1AT01 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700084M14RikB1AT01 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700084M14RikB1AT01 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700084M14RikB1AT01 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
1700084M14RikB1AT01 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700084M14RikB1AT01 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700084M14RikB1AT01 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700084M14RikB1AT01 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700084M14RikB1AT01 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700084M14RikB1AT01 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700084M14RikB1AT01 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700084M14RikB1AT01 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700084M14RikB1AT01 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700084M14RikB1AT01 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700084M14RikB1AT01 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700084M14RikB1AT01 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700084M14RikB1AT01 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700084M14RikB1AT01 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700084M14RikB1AT01 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
1700084M14RikB1AT01 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms