Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Skint5A7XUY5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Skint5A7XUY5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Skint5A7XUY5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Skint5A7XUY5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Skint5A7XUY5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Skint5A7XUY5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Skint5A7XUY5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Skint5A7XUY5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Skint5A7XUY5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Skint5A7XUY5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Skint5A7XUY5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Skint5A7XUY5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Skint5A7XUY5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Skint5A7XUY5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Skint5A7XUY5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Skint5A7XUY5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Skint5A7XUY5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Skint5A7XUY5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Skint5A7XUY5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Skint5A7XUY5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Skint5A7XUY5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Skint5A7XUY5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Skint5A7XUY5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Skint5A7XUY5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Skint5A7XUY5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Skint5A7XUY5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Skint5A7XUY5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms