Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga8A2ARA8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga8A2ARA8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms