Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm11A2AGX3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm11A2AGX3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm11A2AGX3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms