Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc163A2AGD7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc163A2AGD7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms