Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prdm16A2A935 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm16A2A935 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms