Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3550W4VSN7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms