Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms