Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt16Q9Z2K1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt16Q9Z2K1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt16Q9Z2K1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt16Q9Z2K1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt16Q9Z2K1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt16Q9Z2K1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt16Q9Z2K1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt16Q9Z2K1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt16Q9Z2K1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt16Q9Z2K1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt16Q9Z2K1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt16Q9Z2K1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt16Q9Z2K1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt16Q9Z2K1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms