Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd4Q9Z2D7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd4Q9Z2D7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd4Q9Z2D7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd4Q9Z2D7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd4Q9Z2D7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd4Q9Z2D7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd4Q9Z2D7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd4Q9Z2D7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd4Q9Z2D7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd4Q9Z2D7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd4Q9Z2D7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd4Q9Z2D7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd4Q9Z2D7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd4Q9Z2D7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd4Q9Z2D7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd4Q9Z2D7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd4Q9Z2D7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd4Q9Z2D7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd4Q9Z2D7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd4Q9Z2D7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd4Q9Z2D7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd4Q9Z2D7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd4Q9Z2D7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd4Q9Z2D7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd4Q9Z2D7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd4Q9Z2D7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms