Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn7Q9Z261 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn7Q9Z261 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms