Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RfxankQ9Z205 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RfxankQ9Z205 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms