Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clic1Q9Z1Q5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms