Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lgr5Q9Z1P4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lgr5Q9Z1P4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lgr5Q9Z1P4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms