Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xpr1Q9Z0U0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xpr1Q9Z0U0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms