Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUF3

Casp8ap2, CASP8-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,962 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8ap2Q9WUF3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casp8ap2Q9WUF3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casp8ap2Q9WUF3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casp8ap2Q9WUF3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casp8ap2Q9WUF3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casp8ap2Q9WUF3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casp8ap2Q9WUF3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casp8ap2Q9WUF3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms