Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scnn1bQ9WU38 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms