Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vav3Q9R0C8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms