Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE2

Clnk, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClnkQ9QZE2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ClnkQ9QZE2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.7 ms