Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh11Q9QYF1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh11Q9QYF1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh11Q9QYF1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh11Q9QYF1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh11Q9QYF1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh11Q9QYF1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh11Q9QYF1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Rdh11Q9QYF1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh11Q9QYF1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh11Q9QYF1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh11Q9QYF1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh11Q9QYF1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh11Q9QYF1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh11Q9QYF1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh11Q9QYF1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh11Q9QYF1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Rdh11Q9QYF1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh11Q9QYF1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh11Q9QYF1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh11Q9QYF1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Rdh11Q9QYF1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Rdh11Q9QYF1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh11Q9QYF1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh11Q9QYF1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh11Q9QYF1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh11Q9QYF1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Rdh11Q9QYF1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Rdh11Q9QYF1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdh11Q9QYF1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdh11Q9QYF1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdh11Q9QYF1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Rdh11Q9QYF1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Rdh11Q9QYF1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh11Q9QYF1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh11Q9QYF1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh11Q9QYF1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh11Q9QYF1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh11Q9QYF1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh11Q9QYF1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh11Q9QYF1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh11Q9QYF1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh11Q9QYF1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh11Q9QYF1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh11Q9QYF1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh11Q9QYF1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh11Q9QYF1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh11Q9QYF1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh11Q9QYF1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh11Q9QYF1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh11Q9QYF1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh11Q9QYF1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh11Q9QYF1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh11Q9QYF1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh11Q9QYF1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh11Q9QYF1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh11Q9QYF1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh11Q9QYF1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh11Q9QYF1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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