Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nufip1Q9QXX8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nufip1Q9QXX8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms