Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cln8Q9QUK3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cln8Q9QUK3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms