Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl3Q9JMG7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms