Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msgn1Q9JK54 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msgn1Q9JK54 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms