Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnip1Q9JJ57 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip1Q9JJ57 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms