Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET37

Slc5a4a, Solute carrier family 5 member 4A, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4aQ9ET37 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc5a4aQ9ET37 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slc5a4aQ9ET37 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc5a4aQ9ET37 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc5a4aQ9ET37 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms