Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp29Q9ES63 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Usp29Q9ES63 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Usp29Q9ES63 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Usp29Q9ES63 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp29Q9ES63 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp29Q9ES63 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms