Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ripk4Q9ERK0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ripk4Q9ERK0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms